MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Blochmannia vafer str. BVAF chromosome

Total Repeats: 17314

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014909	TTG	2	6	29	34	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319760151
2	NC_014909	AGG	2	6	36	41	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319760151
3	NC_014909	AGC	2	6	60	65	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760151
4	NC_014909	ATA	2	6	110	115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319760151
5	NC_014909	AAT	2	6	204	209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319760151
6	NC_014909	GATC	2	8	223	230	25 %	25 %	25 %	25 %	319760151
7	NC_014909	AGT	2	6	256	261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760151
8	NC_014909	TA	3	6	308	313	50 %	50 %	0 %	0 %	319760151
9	NC_014909	AGA	2	6	336	341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760151
10	NC_014909	TTAT	2	8	348	355	25 %	75 %	0 %	0 %	319760151
11	NC_014909	AT	3	6	354	359	50 %	50 %	0 %	0 %	319760151
12	NC_014909	ATT	2	6	385	390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319760151
13	NC_014909	ATT	2	6	415	420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319760151
14	NC_014909	AAC	2	6	462	467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319760151
15	NC_014909	GAAT	2	8	500	507	50 %	25 %	25 %	0 %	319760151
16	NC_014909	AGG	2	6	516	521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319760151
17	NC_014909	ATC	3	9	540	548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760151
18	NC_014909	AT	3	6	619	624	50 %	50 %	0 %	0 %	319760151
19	NC_014909	AGC	2	6	656	661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760151
20	NC_014909	T	6	6	683	688	0 %	100 %	0 %	0 %	319760151
21	NC_014909	ACA	2	6	708	713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319760151
22	NC_014909	CAT	2	6	784	789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760151
23	NC_014909	T	7	7	890	896	0 %	100 %	0 %	0 %	319760151
24	NC_014909	CTA	2	6	944	949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760151
25	NC_014909	T	7	7	1044	1050	0 %	100 %	0 %	0 %	319760151
26	NC_014909	ATTT	2	8	1086	1093	25 %	75 %	0 %	0 %	319760151
27	NC_014909	ACT	2	6	1126	1131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760151
28	NC_014909	GAA	2	6	1138	1143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760151
29	NC_014909	GCA	3	9	1144	1152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760151
30	NC_014909	ATT	2	6	1158	1163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319760151
31	NC_014909	TAG	2	6	1244	1249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760151
32	NC_014909	TAC	2	6	1269	1274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760151
33	NC_014909	CGTAT	2	10	1280	1289	20 %	40 %	20 %	20 %	319760151
34	NC_014909	AGA	2	6	1326	1331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760151
35	NC_014909	ATTA	2	8	1374	1381	50 %	50 %	0 %	0 %	319760151
36	NC_014909	ATA	2	6	1385	1390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319760151
37	NC_014909	T	6	6	1400	1405	0 %	100 %	0 %	0 %	319760151
38	NC_014909	TAC	2	6	1470	1475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760151
39	NC_014909	ATT	2	6	1480	1485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319760151
40	NC_014909	TTA	2	6	1540	1545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319760151
41	NC_014909	AAAT	2	8	1556	1563	75 %	25 %	0 %	0 %	319760151
42	NC_014909	TTA	2	6	1711	1716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319760151
43	NC_014909	TAA	2	6	1734	1739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319760151
44	NC_014909	TTG	2	6	1742	1747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319760151
45	NC_014909	GGT	2	6	1761	1766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760151
46	NC_014909	ATT	2	6	1778	1783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319760151
47	NC_014909	CTATTT	2	12	1838	1849	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	319760151
48	NC_014909	A	6	6	1863	1868	100 %	0 %	0 %	0 %	319760151
49	NC_014909	A	8	8	1882	1889	100 %	0 %	0 %	0 %	319760151
50	NC_014909	AAT	2	6	1891	1896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319760151
51	NC_014909	AT	3	6	1911	1916	50 %	50 %	0 %	0 %	319760151
52	NC_014909	ACA	2	6	2430	2435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319760152
53	NC_014909	AT	3	6	2436	2441	50 %	50 %	0 %	0 %	319760152
54	NC_014909	CAT	2	6	2446	2451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760152
55	NC_014909	TCA	2	6	2454	2459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760152
56	NC_014909	ATTTG	2	10	2466	2475	20 %	60 %	20 %	0 %	319760152
57	NC_014909	CAT	2	6	2510	2515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760152
58	NC_014909	T	7	7	2545	2551	0 %	100 %	0 %	0 %	319760152
59	NC_014909	ATT	2	6	2556	2561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319760152
60	NC_014909	CAT	2	6	2567	2572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760152
61	NC_014909	TA	3	6	2590	2595	50 %	50 %	0 %	0 %	319760152
62	NC_014909	TAA	2	6	2648	2653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319760152
63	NC_014909	TTAT	2	8	2656	2663	25 %	75 %	0 %	0 %	319760152
64	NC_014909	A	6	6	2697	2702	100 %	0 %	0 %	0 %	319760152
65	NC_014909	T	7	7	2781	2787	0 %	100 %	0 %	0 %	319760152
66	NC_014909	AT	3	6	2790	2795	50 %	50 %	0 %	0 %	319760152
67	NC_014909	TTC	2	6	2817	2822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319760152
68	NC_014909	ATATCA	2	12	2846	2857	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	319760152
69	NC_014909	AT	3	6	2876	2881	50 %	50 %	0 %	0 %	319760152
70	NC_014909	ATC	2	6	2948	2953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760152
71	NC_014909	TAT	2	6	3008	3013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319760152
72	NC_014909	ATT	2	6	3039	3044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319760152
73	NC_014909	TAA	2	6	3080	3085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319760152
74	NC_014909	TGG	2	6	3100	3105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760152
75	NC_014909	ATT	2	6	3151	3156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319760152
76	NC_014909	T	7	7	3155	3161	0 %	100 %	0 %	0 %	319760152
77	NC_014909	TTTTAT	2	12	3168	3179	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	319760152
78	NC_014909	ATT	2	6	3190	3195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319760152
79	NC_014909	TGT	2	6	3342	3347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319760153
80	NC_014909	GCG	2	6	3356	3361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760153
81	NC_014909	ATG	2	6	3365	3370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760153
82	NC_014909	GGC	2	6	3376	3381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760153
83	NC_014909	GCT	2	6	3389	3394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760153
84	NC_014909	GCT	2	6	3434	3439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760153
85	NC_014909	T	6	6	3476	3481	0 %	100 %	0 %	0 %	319760153
86	NC_014909	TATGT	2	10	3536	3545	20 %	60 %	20 %	0 %	319760153
87	NC_014909	CAA	2	6	3662	3667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319760154
88	NC_014909	GTCA	2	8	3674	3681	25 %	25 %	25 %	25 %	319760154
89	NC_014909	T	8	8	3692	3699	0 %	100 %	0 %	0 %	319760154
90	NC_014909	TATG	2	8	3718	3725	25 %	50 %	25 %	0 %	319760154
91	NC_014909	ATT	2	6	3742	3747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319760154
92	NC_014909	GAA	2	6	3865	3870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760154
93	NC_014909	ATT	2	6	3871	3876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319760154
94	NC_014909	ATG	2	6	3911	3916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760154
95	NC_014909	CAA	2	6	3919	3924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319760154
96	NC_014909	TCA	2	6	3930	3935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760154
97	NC_014909	TGTA	2	8	3951	3958	25 %	50 %	25 %	0 %	319760154
98	NC_014909	AAGA	2	8	3980	3987	75 %	0 %	25 %	0 %	319760154
99	NC_014909	TGA	2	6	3999	4004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760154
100	NC_014909	A	8	8	4011	4018	100 %	0 %	0 %	0 %	319760154
101	NC_014909	TTG	2	6	4052	4057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319760154
102	NC_014909	TGA	2	6	4086	4091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760154
103	NC_014909	T	6	6	4138	4143	0 %	100 %	0 %	0 %	319760155
104	NC_014909	ATA	2	6	4202	4207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319760155
105	NC_014909	TTG	2	6	4285	4290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319760155
106	NC_014909	TCT	2	6	4291	4296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319760155
107	NC_014909	CAA	2	6	4297	4302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319760155
108	NC_014909	TTA	2	6	4316	4321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319760155
109	NC_014909	T	7	7	4350	4356	0 %	100 %	0 %	0 %	319760155
110	NC_014909	ATA	2	6	4388	4393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319760155
111	NC_014909	TAT	2	6	4397	4402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319760155
112	NC_014909	AT	5	10	4442	4451	50 %	50 %	0 %	0 %	319760155
113	NC_014909	A	6	6	4508	4513	100 %	0 %	0 %	0 %	319760155
114	NC_014909	CATG	2	8	4520	4527	25 %	25 %	25 %	25 %	319760155
115	NC_014909	ATT	2	6	4532	4537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319760155
116	NC_014909	ATT	2	6	4579	4584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319760155
117	NC_014909	TAA	2	6	4592	4597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319760155
118	NC_014909	AGA	2	6	4605	4610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760155
119	NC_014909	TGT	2	6	4611	4616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319760155
120	NC_014909	ATT	2	6	4674	4679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319760155
121	NC_014909	TAA	2	6	4749	4754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319760156
122	NC_014909	CGT	2	6	4757	4762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760156
123	NC_014909	AATAT	2	10	4770	4779	60 %	40 %	0 %	0 %	319760156
124	NC_014909	TAC	2	6	4810	4815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760156
125	NC_014909	TCAT	2	8	4830	4837	25 %	50 %	0 %	25 %	319760156
126	NC_014909	AT	4	8	4836	4843	50 %	50 %	0 %	0 %	319760156
127	NC_014909	GTA	2	6	4937	4942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760156
128	NC_014909	ATT	2	6	5023	5028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319760156
129	NC_014909	AGT	2	6	5035	5040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760156
130	NC_014909	ATA	2	6	5064	5069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319760156
131	NC_014909	TTA	2	6	5092	5097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319760156
132	NC_014909	CAAT	2	8	5135	5142	50 %	25 %	0 %	25 %	319760156
133	NC_014909	GATA	2	8	5254	5261	50 %	25 %	25 %	0 %	319760156
134	NC_014909	TAT	2	6	5263	5268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319760156
135	NC_014909	CAA	2	6	5322	5327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319760156
136	NC_014909	GTA	2	6	5339	5344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760156
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